يعد قسم علوم البحار التطبيقية أحد أقسام كلية علوم البحار التي تأسست عام 2016 والتي تعد الاولى من نوعها في العراق. يحظى القسم بأهمية  لتوفير مختصين في مجال علوم البحار (جيولوجيا بحرية، فيزياء بحرية، كيمياء بحرية) والتي تناظر مثيلاتها  في الكليات العالمية  اذ تم جمع العلوم الأساسية في تلك التخصصات وتكثيف المعلومات ليكون الطالب على معرفة بهذه العلوم واعداد له خلفية جيدة من خلال دخول الطالب المحاضرات العلمية والمختبرات في تلك الاختصاصات والسفرات الحقلية العلمية تمكنه من الدخول بأحد الاختصاصات المذكور في الدراسات العليا كما سوف تكون له القدرة العالية على الربط بين تلك الاختصاصات ، ولما تمتلك هذه العلوم من أهمية والحاجة لها  كوننا نمتلك واجهة بحرية صغيرة ومهمة عالمين حيث تنشط بها حركة السفن للتجارة وتصدير النفط مما يجعلنا ان نفكر بأعداد كوادر لإدارة هذه المنطقة وخدمة المجتمع وسوق العمل ونشر المعرفة والعلوم ودعم احتياجات المجتمع في مختلف الهيئات البحرية لأعداد الكوادر البشرية من حملة شهادة البكالوريوس للعمل بالقطاعين العام والخاص.